Koillismaan Osuuskaupan hallituksen muodostavat toimitusjohtaja sekä hallintoneuvoston kalenterivuodeksi valitsemat neljä jäsentä. Hallituksen puheenjohtajana toimii sääntömääräisesti toimitusjohtaja. Hallituksen tehtävänä on päättää osuuskaupan tavoitteista, toimintasuunnitelmista, henkilöstöpolitiikasta, investoinneista, rahoitus- ja sijoitusperiaatteista sekä valvoa ja vastata liiketoiminnan menestyksellisyydestä. Hallitus kokoontuu puheenjohtajan kutsusta. Hallintoneuvoston puheenjohtaja ja varapuheenjohtaja osallistuvat hallituksen kokouksiin.
Toimitusjohtajan tehtävänä on johtaa Koillismaan Osuuskaupan toimintaa osuuskunnan sääntöjen ja hallintoelinten ohjeiden mukaisesti. Toimitusjohtaja vastaa strategian kehittämisestä ja uudistamisesta.
Koillismaan Osuuskaupan hallitukseen kuuluvat: Jukka Kihlman (Kuusamo), Reijo Kulmunki (Kemijärvi), Antero Pitkänen (Taivalkoski), Anne Polojärvi (Kuusamo) ja Tapio Suorajärvi (Kuusamo). Hallituksen puheenjohtajana sääntömääräisesti toimii osuuskaupan toimitusjohtaja Jukka Kihlman, varapuheenjohtajana Anne Polojärvi ja sihteerinä talousjohtaja Esa Niinisalo.